| 序号 | 类别 | 办事机构 | 对外业务范畴 | 办公地址 | 办公时间 | 联系电话 |
| 1 | 行政办公 | 办公室 | 如政务公开、信访接待、应急值班、预约服务、干部监督、公务员管理等 | 聊城市东昌府区湖滨路南首 | 工作日 上午8:30-12:00； 下午14:00-17:00 | 0635-8909595 |
| 2 | 政务服务场所 | 报关大厅 | 业务办理、业务咨询 | |||
| 3 | 对外业务科室 | 综合业务科 | 综合业务、关税征管、减免税、统计、原产地证书管理、进出境物品核准 | |||
| 4 | 对外业务科室 | 稽核科 | 稽查作业、核查作业、行政案件执法等 | |||
| 5 | 对外业务科室 | 企业管理科 | 企业资质管理、企业信用管理、进出境动植物生产加工单位注册登记、进出口食品企业备案 | |||
| 6 | 对外业务科室 | 保税业务监管科 | 保税监管场所、加工贸易 | |||
| 7 | 对外业务科室 | 查检一科 | 进出口工业品属地查检（危险品及其包装、其他非危险品工业制成品）、业务咨询,监管作业场所管理等 | |||
| 8 | 对外业务科室 | 查检二科 | 查验，复验，食品化妆品、动植物检验检疫及不合格处置，进出境动植物安全风险监控，国门生物安全监测等 | |||
| 9 | 对外业务科室 | 运行监控科 | 法律事务接待 | |||
| 4 | 事业单位 | 聊城实验室 | 产品检测等 |
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